Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms