Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccndbp1Q3TVC7 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
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