Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ttc39dQ0VF76 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ttc39dQ0VF76 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ttc39dQ0VF76 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ttc39dQ0VF76 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc39dQ0VF76 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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