Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrriq1Q0P5X1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrriq1Q0P5X1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrriq1Q0P5X1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrriq1Q0P5X1 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrriq1Q0P5X1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrriq1Q0P5X1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms