Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ubxn2bQ0KL01 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ubxn2bQ0KL01 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms