Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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Hoxc4Q08624 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Hoxc4Q08624 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hoxc4Q08624 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Hoxc4Q08624 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Hoxc4Q08624 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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