Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Thbs3Q05895 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Thbs3Q05895 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Thbs3Q05895 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Thbs3Q05895 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Thbs3Q05895 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Thbs3Q05895 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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