Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smarcad1Q04692 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms