Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd1Q01822 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms