Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pkn1P70268 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkn1P70268 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms