Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SbdsP70122 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms