Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ube2kP61087 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2kP61087 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms