Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rin3P59729 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms