Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ClgnP52194 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ClgnP52194 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms