Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LtbrP50284 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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