Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Srp9P49962 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp9P49962 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp9P49962 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp9P49962 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Srp9P49962 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms