Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LmnaP48678 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms