Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VdrP48281 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VdrP48281 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VdrP48281 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms