Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nedd4P46935 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms