Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms