Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx1-2P42580 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms