Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ThpoP40226 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms