Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms