Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd12P23812 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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