Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prim1P20664 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prim1P20664 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms