Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxd4P10628 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms