Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04212 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04212 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04212 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04212 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
P04212 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04212 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04212 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04212 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04212 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04212 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04212 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
P04212 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04212 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04212 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04212 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04212 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04212 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04212 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04212 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms