Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms