Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ascl4M0QW46 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms