Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cldn34c3J3QJW5 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Cldn34c3J3QJW5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Cldn34c3J3QJW5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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