Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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