Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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