Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms