Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm3543D3Z235 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms