Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms