Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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H2-M5A7VMS3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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H2-M5A7VMS3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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