Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Rtf1A2AQ19 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Rtf1A2AQ19 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Rtf1A2AQ19 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Rtf1A2AQ19 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Rtf1A2AQ19 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Rtf1A2AQ19 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms