Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Syndig1A2ANU3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Syndig1A2ANU3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms