Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3550W4VSN7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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