Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trip6Q9Z1Y4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms