Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Nubp2Q9R061 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Nubp2Q9R061 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Nubp2Q9R061 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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