Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXP6

Mkrn1, E3 ubiquitin-protein ligase makorin-1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn1Q9QXP6 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mkrn1Q9QXP6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mkrn1Q9QXP6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms