Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Mid2Q9QUS6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.1 ms