Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms