Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ube3bQ9ES34 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ube3bQ9ES34 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ube3bQ9ES34 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ube3bQ9ES34 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ube3bQ9ES34 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ube3bQ9ES34 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ube3bQ9ES34 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ube3bQ9ES34 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms