Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Clstn1Q9EPL2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Clstn1Q9EPL2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Clstn1Q9EPL2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Clstn1Q9EPL2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Clstn1Q9EPL2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Clstn1Q9EPL2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clstn1Q9EPL2 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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