Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hmg20aQ9DC33 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hmg20aQ9DC33 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hmg20aQ9DC33 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hmg20aQ9DC33 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hmg20aQ9DC33 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hmg20aQ9DC33 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hmg20aQ9DC33 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hmg20aQ9DC33 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hmg20aQ9DC33 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hmg20aQ9DC33 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hmg20aQ9DC33 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hmg20aQ9DC33 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms