Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Ccdc97Q9DBT3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Ccdc97Q9DBT3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Ccdc97Q9DBT3 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ccdc97Q9DBT3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ccdc97Q9DBT3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ccdc97Q9DBT3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ccdc97Q9DBT3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ccdc97Q9DBT3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ccdc97Q9DBT3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ccdc97Q9DBT3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ccdc97Q9DBT3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ccdc97Q9DBT3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ccdc97Q9DBT3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc97Q9DBT3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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