Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gtf3c6Q9D8P7 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gtf3c6Q9D8P7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gtf3c6Q9D8P7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gtf3c6Q9D8P7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gtf3c6Q9D8P7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gtf3c6Q9D8P7 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gtf3c6Q9D8P7 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gtf3c6Q9D8P7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gtf3c6Q9D8P7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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