Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chmp5Q9D7S9 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp5Q9D7S9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms